Le attività del GECT sono coordinate dal Segretario generale, assistito dai rappresentanti degli altri due membri. Le decisioni del Segretariato generale vengono prese previa consultazione degli altri membri del Segretariato generale.
Il funzionario o la funzionaria del territorio membro che detiene la presidenza svolge le funzioni di Segretario generale o di Segretaria generale. La carica di Segretario generale viene quindi alternata ogni due anni tra i membri dell’Euregio, contemporaneamente alla presidenza.
Il Segretario generale o la Segretaria generale svolge, tra l’altro, i compiti seguenti:
prepara le riunioni della Giunta e dell’Assemblea;
assiste il Presidente nell’esercizio delle sue funzioni;
provvede all’esecuzione delle deliberazioni della Giunta, anche avvalendosi della collaborazione delle strutture amministrative dei membri.
Per l’espletamento delle proprie funzioni il Segretario generale può adottare determine.